A Federação é a entidade que congrega cada um dos tipos de Sociedades Internas das igrejas jurisdicionadas a um Presbitério da IPB, ao qual se subordina e que funciona sob a supervisão de um Secretário Presbiterial.
São finalidades da Federação:
- Promover, incentivar e coordenar o intercâmbio entre as suas respectivas Sociedades federadas;
- Planejar e realizar encontros periódicos e um Congresso Anual;
- Funcionar como elo entre as Sociedades Internas e a Confederação Sinodal, tomando parte em suas reuniões através de Delegados credenciados;
- Incentivar a organização ou reorganização das Sociedades Internas locais, mediante a aprovação do Conselho, fazendo-se representar nestas organizações;
- Dar às Sociedades Internas locais instruções e sugestões sobre planos de trabalho e indicar-lhes literatura específica.